Laser frakcyjny ablacyjny powoduje ściśle kontrolowany, fototermiczny uraz skóry. Może działać tylko w naskórku (wtedy zabieg nazywamy mikrodermabrazją laserową), a mimo to docierać do głębszych warstw skóry właściwej. Światło lasera ablacyjnego CO2 wnika w skórę i jest absorbowane przez zawartą w niej wodę. W wyniku reakcji fototermicznej dochodzi do błyskawicznego podgrzania wody w tkance i jej odparowania, co tworzy mikroskopijne kolumny w skórze. W ten sposób w skórze zostaje uruchomiona kaskada regeneracji – zawarty w niej kolagen ulega obkurczeniu, zaczyna się proces uzupełniania powstałych ubytków, czyli tworzenie nowych włókien kolagenowych. Podczas tego procesu zostaje także wydzielone ciepło, które uszkadza sąsiednie komórki. Oczywiście podczas jednej sesji laseroterapii nie można wytworzyć zbyt masywnych uszkodzeń, dlatego tak ważne jest dobranie parametrów laserowych do problemu, fototypu skóry czy możliwości gojenia się skóry pacjenta. ”Dziurkowanie” skóry odbywa się w równych odstępach, zazwyczaj co 1 mm (można tę odległość wydłużyć lub skrócić). Należy pamiętać, że efekt zabiegu laserem CO2 nie jest natychmiastowy – proces przebudowy i syntezy kolagenu trwa kilka tygodni, i tyle należy poczekać na wyniki terapii.